Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0X1

Smim9, Small integral membrane protein 9, mousemouse

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Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim9Q3V0X1 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Smim9Q3V0X1 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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