Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Ccl11-201ENSMUST00000000342 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Lrrc43Q3V0L5 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Gm38116-201ENSMUST00000193873 1533 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Lrrc43Q3V0L5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms