Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
4930596D02RikQ3V0H9 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
4930596D02RikQ3V0H9 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms