Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Garnl3Q3V0G7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Garnl3Q3V0G7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms