Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
4933416C03RikQ3V063 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
4933416C03RikQ3V063 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4933416C03RikQ3V063 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4933416C03RikQ3V063 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4933416C03RikQ3V063 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
4933416C03RikQ3V063 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
4933416C03RikQ3V063 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
4933416C03RikQ3V063 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
4933416C03RikQ3V063 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms