Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Capn13Q3UW68 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Capn13Q3UW68 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms