Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW50

Gm27235, Predicted gene 27235, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm27235Q3UW50 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Gm27235Q3UW50 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Gm27235Q3UW50 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
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