Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW31

Pate2, Prostate and testis expressed protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate2Q3UW31 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pate2Q3UW31 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pate2Q3UW31 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms