Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW21

Clpsl2, Colipase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clpsl2Q3UW21 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Clpsl2Q3UW21 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Clpsl2Q3UW21 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms