Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Slfn4Q3UV66 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Slfn4Q3UV66 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms