Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-Eb2Q3UUV9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms