Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Obox3Q3UT54 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Obox3Q3UT54 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms