Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm28047Q3US59 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms