Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Rtl4Q3URY0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Rtl4Q3URY0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Rtl4Q3URY0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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