Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cog7Q3UM29 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cog7Q3UM29 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms