Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULP7

Ctsll3, Cathepsin L-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctsll3Q3ULP7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ctsll3Q3ULP7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ctsll3Q3ULP7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms