Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJ22

Gm648, Gene model 648, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm648Q3UJ22 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Gm648Q3UJ22 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 121.5 ms