Protein–RNA interactions for Protein: Q3UIR3

Dtx3l, E3 ubiquitin-protein ligase DTX3L, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dtx3lQ3UIR3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dtx3lQ3UIR3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms