Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Lmod2Q3UHZ5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lmod2Q3UHZ5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms