Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHK3

Greb1, Protein GREB1, mousemouse

Predictions only

Length 1,954 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1Q3UHK3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Greb1Q3UHK3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Greb1Q3UHK3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms