Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rrp36Q3UFY0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rrp36Q3UFY0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms