Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Zyg11bQ3UFS0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms