Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDN3

Gm45902, Predicted gene 45902, mousemouse

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm45902Q3UDN3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45902Q3UDN3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm45902Q3UDN3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45902Q3UDN3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45902Q3UDN3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45902Q3UDN3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45902Q3UDN3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45902Q3UDN3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45902Q3UDN3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45902Q3UDN3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45902Q3UDN3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45902Q3UDN3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45902Q3UDN3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45902Q3UDN3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45902Q3UDN3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45902Q3UDN3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45902Q3UDN3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45902Q3UDN3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45902Q3UDN3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45902Q3UDN3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm45902Q3UDN3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm45902Q3UDN3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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