Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Trafd1Q3UDK1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms