Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3U6N9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U6N9 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U6N9 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U6N9 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q3U6N9 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q3U6N9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U6N9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q3U6N9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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