Protein–RNA interactions for Protein: Q3U410

Klhl21, Kelch-like protein 21, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl21Q3U410 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl21Q3U410 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl21Q3U410 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl21Q3U410 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl21Q3U410 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl21Q3U410 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl21Q3U410 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl21Q3U410 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl21Q3U410 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl21Q3U410 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl21Q3U410 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl21Q3U410 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl21Q3U410 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl21Q3U410 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl21Q3U410 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl21Q3U410 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl21Q3U410 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl21Q3U410 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl21Q3U410 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Klhl21Q3U410 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Klhl21Q3U410 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Klhl21Q3U410 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms