Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Kdm4dQ3U2K5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Kdm4dQ3U2K5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms