Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem35bQ3U0Y2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem35bQ3U0Y2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms