Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0P1

Palb2, Partner and localizer of BRCA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,104 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Palb2Q3U0P1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Palb2Q3U0P1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Palb2Q3U0P1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms