Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Trappc9Q3U0M1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Trappc9Q3U0M1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms