Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0D9

Hace1, E3 ubiquitin-protein ligase HACE1, mousemouse

Predictions only

Length 909 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hace1Q3U0D9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hace1Q3U0D9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms