Protein–RNA interactions for Protein: Q3TX51

Lrrc28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc28Q3TX51 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lrrc28Q3TX51 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lrrc28Q3TX51 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms