Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
TchpQ3TVW5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TchpQ3TVW5 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms