Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Q3TTJ4 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3TTJ4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms