Protein–RNA interactions for Protein: Q3TSA9

Fbxw18, Expressed sequence C85627, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw18Q3TSA9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Fbxw18Q3TSA9 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Fbxw18Q3TSA9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms