Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQS0

Calr4, Calreticulin 4, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr4Q3TQS0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Calr4Q3TQS0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Calr4Q3TQS0 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms