Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMW1

Ccdc102a, Coiled-coil domain-containing protein 102A, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc102aQ3TMW1 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ccdc102aQ3TMW1 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc102aQ3TMW1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms