Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gtf3c3Q3TMP1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gtf3c3Q3TMP1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms