Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKT4

Smarca4, Transcription activator BRG1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca4Q3TKT4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Smarca4Q3TKT4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Smarca4Q3TKT4 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
Smarca4Q3TKT4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms