Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nlrp4cQ3TKR3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms