Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trappc13Q3TIR1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trappc13Q3TIR1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms