Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2afvQ3THW5 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2afvQ3THW5 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms