Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ccdc69Q3TCJ8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms