Protein–RNA interactions for Protein: Q3LRV9

Treml4, Trem-like transcript 4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml4Q3LRV9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Treml4Q3LRV9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms