Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNY5

Riiad1, RIIa domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riiad1Q3KNY5 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Riiad1Q3KNY5 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Riiad1Q3KNY5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms