Protein–RNA interactions for Protein: Q2TJ95

Rspo3, R-spondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo3Q2TJ95 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rspo3Q2TJ95 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rspo3Q2TJ95 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms