Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKI2

Vax1, Ventral anterior homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vax1Q2NKI2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Vax1Q2NKI2 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms