Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Nlrp1aQ2LKU9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nlrp1aQ2LKU9 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms