Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Cd300lgQ1ERP8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms