Protein–RNA interactions for Protein: Q1EHW4

Sap25, Histone deacetylase complex subunit SAP25, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sap25Q1EHW4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sap25Q1EHW4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sap25Q1EHW4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms